Protein–RNA interactions for Protein: P97355

Sms, Spermine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmsP97355 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SmsP97355 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SmsP97355 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SmsP97355 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SmsP97355 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SmsP97355 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SmsP97355 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
SmsP97355 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SmsP97355 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SmsP97355 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SmsP97355 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SmsP97355 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SmsP97355 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SmsP97355 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SmsP97355 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SmsP97355 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SmsP97355 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SmsP97355 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
SmsP97355 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SmsP97355 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SmsP97355 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SmsP97355 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SmsP97355 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SmsP97355 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SmsP97355 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SmsP97355 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SmsP97355 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SmsP97355 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SmsP97355 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
SmsP97355 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SmsP97355 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SmsP97355 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
SmsP97355 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SmsP97355 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SmsP97355 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SmsP97355 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SmsP97355 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SmsP97355 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SmsP97355 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SmsP97355 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
SmsP97355 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
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SmsP97355 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SmsP97355 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SmsP97355 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SmsP97355 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SmsP97355 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
SmsP97355 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SmsP97355 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SmsP97355 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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SmsP97355 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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SmsP97355 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
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SmsP97355 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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SmsP97355 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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SmsP97355 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
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SmsP97355 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SmsP97355 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SmsP97355 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SmsP97355 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
SmsP97355 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
SmsP97355 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
SmsP97355 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
SmsP97355 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
SmsP97355 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
SmsP97355 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
SmsP97355 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
SmsP97355 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
SmsP97355 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
SmsP97355 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
SmsP97355 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
SmsP97355 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
SmsP97355 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
SmsP97355 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SmsP97355 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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SmsP97355 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SmsP97355 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SmsP97355 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SmsP97355 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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