Protein–RNA interactions for Protein: P84078

Arf1, ADP-ribosylation factor 1, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf1P84078 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Arf1P84078 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Arf1P84078 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Arf1P84078 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Arf1P84078 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Arf1P84078 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Arf1P84078 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Arf1P84078 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Arf1P84078 Gm44271-201ENSMUST00000204525 2600 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Arf1P84078 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Arf1P84078 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Arf1P84078 Slc25a12-206ENSMUST00000151937 6351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Arf1P84078 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Arf1P84078 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Arf1P84078 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Arf1P84078 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Arf1P84078 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Arf1P84078 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Arf1P84078 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Arf1P84078 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Arf1P84078 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Arf1P84078 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Arf1P84078 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Arf1P84078 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Arf1P84078 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Arf1P84078 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Arf1P84078 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Arf1P84078 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Arf1P84078 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Arf1P84078 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Arf1P84078 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Arf1P84078 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Arf1P84078 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Arf1P84078 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Arf1P84078 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Arf1P84078 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Arf1P84078 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Arf1P84078 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Arf1P84078 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Arf1P84078 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Arf1P84078 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Arf1P84078 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Arf1P84078 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Arf1P84078 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Arf1P84078 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Arf1P84078 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Arf1P84078 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Arf1P84078 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Arf1P84078 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Arf1P84078 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Arf1P84078 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Arf1P84078 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Arf1P84078 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Arf1P84078 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Arf1P84078 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Arf1P84078 Fbxo40-202ENSMUST00000114806 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Arf1P84078 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Arf1P84078 Gm32742-201ENSMUST00000210433 8516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Arf1P84078 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Arf1P84078 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Arf1P84078 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Arf1P84078 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Arf1P84078 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Arf1P84078 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Arf1P84078 Polr2a-201ENSMUST00000058470 6740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Mthfsd-201ENSMUST00000047282 8312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Pcdh18-201ENSMUST00000035931 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Dopey2-201ENSMUST00000045004 7319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Arap1-201ENSMUST00000084895 4404 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arf1P84078 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms