Protein–RNA interactions for Protein: P63072

Ubd, Ubiquitin D, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbdP63072 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
UbdP63072 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
UbdP63072 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
UbdP63072 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
UbdP63072 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
UbdP63072 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
UbdP63072 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC9.91□□□□□ -0.82
UbdP63072 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC9.91□□□□□ -0.82
UbdP63072 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
UbdP63072 Tcaf1-202ENSMUST00000045140 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
UbdP63072 Tgfbrap1-201ENSMUST00000095014 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
UbdP63072 Slc6a20b-201ENSMUST00000026273 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
UbdP63072 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
UbdP63072 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
UbdP63072 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
UbdP63072 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
UbdP63072 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
UbdP63072 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
UbdP63072 Ybey-201ENSMUST00000049185 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
UbdP63072 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
UbdP63072 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
UbdP63072 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
UbdP63072 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
UbdP63072 Ankrd11-201ENSMUST00000098333 7995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
UbdP63072 Rnft2-201ENSMUST00000117177 4381 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
UbdP63072 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
UbdP63072 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
UbdP63072 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
UbdP63072 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
UbdP63072 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
UbdP63072 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
UbdP63072 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
UbdP63072 Zdhhc21-201ENSMUST00000030110 8763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
UbdP63072 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
UbdP63072 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
UbdP63072 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
UbdP63072 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
UbdP63072 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
UbdP63072 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
UbdP63072 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
UbdP63072 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
UbdP63072 Fyco1-202ENSMUST00000167595 7692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
UbdP63072 AL645745.1-201ENSMUST00000222202 5348 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
UbdP63072 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
UbdP63072 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
UbdP63072 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
UbdP63072 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
UbdP63072 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
UbdP63072 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
UbdP63072 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
UbdP63072 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
UbdP63072 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
UbdP63072 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
UbdP63072 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
UbdP63072 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
UbdP63072 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
UbdP63072 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
UbdP63072 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
UbdP63072 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
UbdP63072 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
UbdP63072 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
UbdP63072 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
UbdP63072 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.82
UbdP63072 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
UbdP63072 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
UbdP63072 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
UbdP63072 9330175E14Rik-201ENSMUST00000180445 4852 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
UbdP63072 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
UbdP63072 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
UbdP63072 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
UbdP63072 Fndc7-207ENSMUST00000180063 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
UbdP63072 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
UbdP63072 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
UbdP63072 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
UbdP63072 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
UbdP63072 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
UbdP63072 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
UbdP63072 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
UbdP63072 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
UbdP63072 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
UbdP63072 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
UbdP63072 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
UbdP63072 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
UbdP63072 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
UbdP63072 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
UbdP63072 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
UbdP63072 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
UbdP63072 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
UbdP63072 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
UbdP63072 Helz-202ENSMUST00000100305 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
UbdP63072 Ppp1r26-205ENSMUST00000189694 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
UbdP63072 Ppp1r26-201ENSMUST00000040324 5466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
UbdP63072 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
UbdP63072 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
UbdP63072 Hyou1-206ENSMUST00000161318 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
UbdP63072 Rnf216-201ENSMUST00000053498 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
UbdP63072 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
UbdP63072 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
UbdP63072 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
UbdP63072 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms