Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 Mir8091-201ENSMUST00000183602 139 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Gm3409-203ENSMUST00000199142 1167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Gm3402-203ENSMUST00000200228 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Olfr1358-201ENSMUST00000204477 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Fhitos-201ENSMUST00000160149 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Bet1-201ENSMUST00000049166 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Olfr171-202ENSMUST00000205467 1406 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Ces2f-203ENSMUST00000212926 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Gm14993-201ENSMUST00000121180 164 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Gm12453-201ENSMUST00000121981 331 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Lrrc75aos2-202ENSMUST00000128647 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Gm12681-201ENSMUST00000132337 700 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Atad3aos-202ENSMUST00000150777 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Gm29521-201ENSMUST00000187061 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Nmbr-206ENSMUST00000190114 662 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Rpl15-ps5-201ENSMUST00000205636 605 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Gm18204-201ENSMUST00000209835 793 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Sept4-202ENSMUST00000063156 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Prss51-201ENSMUST00000063785 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Olfr963-201ENSMUST00000073433 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Olfr700-201ENSMUST00000079936 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Ackr2-202ENSMUST00000214340 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Oprm1-222ENSMUST00000135502 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nphp4P59240 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nphp4P59240 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nphp4P59240 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nphp4P59240 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nphp4P59240 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nphp4P59240 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nphp4P59240 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nphp4P59240 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nphp4P59240 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nphp4P59240 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nphp4P59240 Rbfox1-202ENSMUST00000115841 1191 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nphp4P59240 Gm15620-201ENSMUST00000122949 270 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Nphp4P59240 Gm13709-201ENSMUST00000138573 614 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nphp4P59240 C330021F23Rik-204ENSMUST00000151633 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nphp4P59240 Gm13572-201ENSMUST00000153675 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nphp4P59240 Gm3250-201ENSMUST00000167358 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nphp4P59240 Gm3238-201ENSMUST00000168298 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nphp4P59240 Gm28529-201ENSMUST00000186159 387 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nphp4P59240 Tmbim7-204ENSMUST00000198739 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nphp4P59240 Gm43506-201ENSMUST00000200675 753 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Nphp4P59240 Gm33080-201ENSMUST00000205429 172 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Nphp4P59240 Gm30978-201ENSMUST00000211581 1066 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nphp4P59240 Chordc1-202ENSMUST00000213605 519 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nphp4P59240 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Nphp4P59240 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nphp4P59240 Mustn1-201ENSMUST00000040715 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nphp4P59240 C330021F23Rik-201ENSMUST00000086479 1111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nphp4P59240 Vmn1r44-201ENSMUST00000089420 1108 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nphp4P59240 Gm6040-201ENSMUST00000095430 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nphp4P59240 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nphp4P59240 9430015G10Rik-202ENSMUST00000105576 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nphp4P59240 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nphp4P59240 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nphp4P59240 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nphp4P59240 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nphp4P59240 AC113282.5-201ENSMUST00000224330 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nphp4P59240 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nphp4P59240 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nphp4P59240 Nxf2-202ENSMUST00000113187 2316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nphp4P59240 Tubb1-201ENSMUST00000016399 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nphp4P59240 4930402K13Rik-201ENSMUST00000059967 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nphp4P59240 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nphp4P59240 2610028H24Rik-202ENSMUST00000105415 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nphp4P59240 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nphp4P59240 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nphp4P59240 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms