Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Gm35021-201ENSMUST00000210105 2329 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Cycs-202ENSMUST00000161401 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp25P57080 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp25P57080 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp25P57080 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Glb1l2-207ENSMUST00000162702 2555 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp25P57080 1500012K07Rik-201ENSMUST00000181846 2345 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Rpe65-202ENSMUST00000196999 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Impa1-202ENSMUST00000118410 2988 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Prorsd1-202ENSMUST00000133103 2126 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Ttll13-201ENSMUST00000058266 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp25P57080 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Rnf40-206ENSMUST00000206914 3735 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp25P57080 BC049352-203ENSMUST00000171799 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms