Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
TspoP50637 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
TspoP50637 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
TspoP50637 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
TspoP50637 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
TspoP50637 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
TspoP50637 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
TspoP50637 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
TspoP50637 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
TspoP50637 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
TspoP50637 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
TspoP50637 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
TspoP50637 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
TspoP50637 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
TspoP50637 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
TspoP50637 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
TspoP50637 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
TspoP50637 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
TspoP50637 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
TspoP50637 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
TspoP50637 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
TspoP50637 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
TspoP50637 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
TspoP50637 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
TspoP50637 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
TspoP50637 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
TspoP50637 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
TspoP50637 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
TspoP50637 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
TspoP50637 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
TspoP50637 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
TspoP50637 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
TspoP50637 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
TspoP50637 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
TspoP50637 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
TspoP50637 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
TspoP50637 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC9.61□□□□□ -0.87
TspoP50637 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC9.61□□□□□ -0.87
TspoP50637 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
TspoP50637 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
TspoP50637 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
TspoP50637 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
TspoP50637 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
TspoP50637 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
TspoP50637 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
TspoP50637 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
TspoP50637 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
TspoP50637 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC9.61□□□□□ -0.87
TspoP50637 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
TspoP50637 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
TspoP50637 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
TspoP50637 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
TspoP50637 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
TspoP50637 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
TspoP50637 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
TspoP50637 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
TspoP50637 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
TspoP50637 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
TspoP50637 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
TspoP50637 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
TspoP50637 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
TspoP50637 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
TspoP50637 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
TspoP50637 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
TspoP50637 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
TspoP50637 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
TspoP50637 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
TspoP50637 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
TspoP50637 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
TspoP50637 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
TspoP50637 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
TspoP50637 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
TspoP50637 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
TspoP50637 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
TspoP50637 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
TspoP50637 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
TspoP50637 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
TspoP50637 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
TspoP50637 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
TspoP50637 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
TspoP50637 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
TspoP50637 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
TspoP50637 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
TspoP50637 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
TspoP50637 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
TspoP50637 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
TspoP50637 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
TspoP50637 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
TspoP50637 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
TspoP50637 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
TspoP50637 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
TspoP50637 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
TspoP50637 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
TspoP50637 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
TspoP50637 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
TspoP50637 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
TspoP50637 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
TspoP50637 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
TspoP50637 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
TspoP50637 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74 ms