Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
FmodP50608 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
FmodP50608 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
FmodP50608 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC9.28□□□□□ -0.92
FmodP50608 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
FmodP50608 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
FmodP50608 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
FmodP50608 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
FmodP50608 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
FmodP50608 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
FmodP50608 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
FmodP50608 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
FmodP50608 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
FmodP50608 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
FmodP50608 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
FmodP50608 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
FmodP50608 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
FmodP50608 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
FmodP50608 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
FmodP50608 Zfp354b-201ENSMUST00000109124 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
FmodP50608 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
FmodP50608 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
FmodP50608 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
FmodP50608 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
FmodP50608 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
FmodP50608 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
FmodP50608 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
FmodP50608 Usp17le-202ENSMUST00000211384 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
FmodP50608 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
FmodP50608 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
FmodP50608 Hk3-201ENSMUST00000052949 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
FmodP50608 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
FmodP50608 Pex19-202ENSMUST00000111252 2844 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
FmodP50608 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
FmodP50608 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
FmodP50608 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.92
FmodP50608 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
FmodP50608 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.92
FmodP50608 Abl2-202ENSMUST00000166172 10151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
FmodP50608 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC9.27□□□□□ -0.92
FmodP50608 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
FmodP50608 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
FmodP50608 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
FmodP50608 Tor1aip2-201ENSMUST00000060404 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
FmodP50608 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
FmodP50608 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
FmodP50608 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
FmodP50608 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
FmodP50608 Mapre2-203ENSMUST00000118826 3052 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
FmodP50608 Sorbs3-203ENSMUST00000227653 3061 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
FmodP50608 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
FmodP50608 Unkl-202ENSMUST00000039734 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
FmodP50608 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC9.27□□□□□ -0.93
FmodP50608 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
FmodP50608 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC9.27□□□□□ -0.93
FmodP50608 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
FmodP50608 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC9.27□□□□□ -0.93
FmodP50608 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
FmodP50608 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
FmodP50608 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
FmodP50608 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
FmodP50608 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
FmodP50608 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
FmodP50608 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
FmodP50608 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
FmodP50608 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
FmodP50608 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
FmodP50608 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
FmodP50608 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
FmodP50608 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
FmodP50608 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
FmodP50608 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
FmodP50608 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
FmodP50608 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.27□□□□□ -0.93
FmodP50608 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
FmodP50608 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
FmodP50608 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
FmodP50608 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
FmodP50608 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
FmodP50608 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
FmodP50608 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
FmodP50608 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
FmodP50608 Gm45161-201ENSMUST00000207316 2263 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
FmodP50608 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
FmodP50608 Immt-205ENSMUST00000166938 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
FmodP50608 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
FmodP50608 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
FmodP50608 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
FmodP50608 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
FmodP50608 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
FmodP50608 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
FmodP50608 Vmn1r16-203ENSMUST00000228356 3492 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
FmodP50608 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
FmodP50608 Csnk1g1-214ENSMUST00000206594 2482 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
FmodP50608 Asb1-201ENSMUST00000027538 5826 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
FmodP50608 Cacna2d4-201ENSMUST00000037434 5803 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
FmodP50608 Atf7ip2-201ENSMUST00000044005 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
FmodP50608 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
FmodP50608 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
FmodP50608 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms