Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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Tmod1P49813 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
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Tmod1P49813 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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Tmod1P49813 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
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Tmod1P49813 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
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Tmod1P49813 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Tmod1P49813 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Tmod1P49813 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Tmod1P49813 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Tmod1P49813 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Tmod1P49813 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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