Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrprbP47758 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrprbP47758 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrprbP47758 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrprbP47758 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrprbP47758 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SrprbP47758 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SrprbP47758 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SrprbP47758 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms