Protein–RNA interactions for Protein: P42209

Sept1, Septin-1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept1P42209 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Sept1P42209 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sept1P42209 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sept1P42209 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Sept1P42209 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sept1P42209 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Sept1P42209 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sept1P42209 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sept1P42209 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sept1P42209 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sept1P42209 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sept1P42209 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sept1P42209 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sept1P42209 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sept1P42209 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sept1P42209 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sept1P42209 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sept1P42209 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sept1P42209 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sept1P42209 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sept1P42209 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sept1P42209 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sept1P42209 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sept1P42209 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sept1P42209 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sept1P42209 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sept1P42209 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sept1P42209 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sept1P42209 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sept1P42209 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sept1P42209 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sept1P42209 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Sept1P42209 Gm11417-201ENSMUST00000150536 920 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sept1P42209 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Sept1P42209 1110036E04Rik-201ENSMUST00000181151 777 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sept1P42209 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Sept1P42209 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Sept1P42209 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sept1P42209 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sept1P42209 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sept1P42209 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Sept1P42209 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sept1P42209 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sept1P42209 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sept1P42209 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sept1P42209 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sept1P42209 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sept1P42209 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sept1P42209 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Sept1P42209 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sept1P42209 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sept1P42209 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sept1P42209 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sept1P42209 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sept1P42209 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sept1P42209 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Sept1P42209 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sept1P42209 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sept1P42209 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sept1P42209 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sept1P42209 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sept1P42209 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sept1P42209 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sept1P42209 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sept1P42209 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Sept1P42209 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Sept1P42209 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sept1P42209 Gm16030-201ENSMUST00000159098 603 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Sept1P42209 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sept1P42209 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sept1P42209 1700109G14Rik-202ENSMUST00000188538 754 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sept1P42209 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sept1P42209 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Sept1P42209 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Sept1P42209 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sept1P42209 Gm7525-201ENSMUST00000219425 454 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Sept1P42209 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sept1P42209 Olfr889-201ENSMUST00000072290 945 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sept1P42209 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Sept1P42209 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sept1P42209 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sept1P42209 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sept1P42209 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Sept1P42209 1500004A13Rik-209ENSMUST00000185189 1659 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sept1P42209 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sept1P42209 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sept1P42209 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sept1P42209 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sept1P42209 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sept1P42209 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sept1P42209 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sept1P42209 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sept1P42209 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sept1P42209 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sept1P42209 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sept1P42209 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sept1P42209 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sept1P42209 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sept1P42209 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sept1P42209 Gm25053-201ENSMUST00000103982 133 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms