Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
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