Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Snrnp27-201ENSMUST00000001186 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Gm13758-201ENSMUST00000118699 743 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Cyp2j15-ps-201ENSMUST00000122267 686 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PtprmP28828 n-R5s154-201ENSMUST00000122513 108 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Gm45591-201ENSMUST00000129058 843 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtprmP28828 1810058I24Rik-201ENSMUST00000130875 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Vmn2r-ps54-203ENSMUST00000150856 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Dnajc4-202ENSMUST00000179118 840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Prss23os-203ENSMUST00000208814 975 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Prss23os-204ENSMUST00000209064 972 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Gm45808-201ENSMUST00000210701 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Gm9790-201ENSMUST00000054148 288 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Olfr963-201ENSMUST00000073433 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Gpr19-213ENSMUST00000215088 1484 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Gm46339-201ENSMUST00000222720 3539 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Gm14231-201ENSMUST00000120090 592 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Gm13898-201ENSMUST00000141865 610 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Mrgpra2a-201ENSMUST00000159004 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Gm16560-201ENSMUST00000159115 404 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Fam240a-201ENSMUST00000177678 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Gm37872-201ENSMUST00000192362 886 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Zfp389-202ENSMUST00000224437 1234 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PtprmP28828 AC123061.1-201ENSMUST00000228021 999 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Mrps18b-201ENSMUST00000025305 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Gm25483-201ENSMUST00000083224 227 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PtprmP28828 9530059O14Rik-204ENSMUST00000215759 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Ccser2-203ENSMUST00000182042 1420 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Tcl1b4-202ENSMUST00000222867 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Xlr4c-201ENSMUST00000068551 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Serpinb6a-203ENSMUST00000076532 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Mrps23-202ENSMUST00000107915 332 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Gm14650-201ENSMUST00000120400 889 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Gm44805-201ENSMUST00000127648 765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Gm15472-201ENSMUST00000141652 847 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Gm13817-201ENSMUST00000142249 604 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Gm6038-201ENSMUST00000154310 948 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Slirp-202ENSMUST00000160488 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Gm20474-201ENSMUST00000180089 596 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PtprmP28828 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Gm40153-201ENSMUST00000197904 637 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtprmP28828 AC158518.1-201ENSMUST00000216435 320 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtprmP28828 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Srd5a3-203ENSMUST00000113507 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtprmP28828 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Gm36211-201ENSMUST00000198171 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Cyp2d41-ps-201ENSMUST00000180453 1503 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtprmP28828 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Gm24066-201ENSMUST00000104515 131 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Gm16480-201ENSMUST00000120439 832 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Rpl10-ps6-201ENSMUST00000121321 642 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PtprmP28828 7330404K18Rik-201ENSMUST00000125558 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtprmP28828 4930529I22Rik-201ENSMUST00000131509 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtprmP28828 D730045A05Rik-201ENSMUST00000159260 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Anp32e-206ENSMUST00000169426 915 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Gm5205-201ENSMUST00000182253 1003 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
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