Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Myh13-201ENSMUST00000081911 5817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms