Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
P20040 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
P20040 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P20040 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P20040 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P20040 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P20040 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P20040 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P20040 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P20040 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P20040 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P20040 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P20040 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P20040 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
P20040 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
P20040 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
P20040 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P20040 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P20040 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P20040 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P20040 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
P20040 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
P20040 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P20040 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
P20040 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P20040 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P20040 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P20040 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P20040 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P20040 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P20040 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P20040 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P20040 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P20040 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P20040 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P20040 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P20040 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P20040 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P20040 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P20040 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P20040 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P20040 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
P20040 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
P20040 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P20040 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P20040 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P20040 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P20040 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
P20040 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P20040 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P20040 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P20040 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P20040 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P20040 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P20040 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P20040 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P20040 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P20040 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P20040 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
P20040 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
P20040 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
P20040 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P20040 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P20040 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P20040 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P20040 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P20040 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P20040 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P20040 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P20040 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P20040 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P20040 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
P20040 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P20040 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
P20040 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
P20040 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P20040 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P20040 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
P20040 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P20040 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P20040 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P20040 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P20040 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P20040 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P20040 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P20040 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P20040 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P20040 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P20040 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P20040 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P20040 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P20040 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P20040 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
P20040 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P20040 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P20040 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P20040 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P20040 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P20040 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P20040 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
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