Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PcnaP17918 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PcnaP17918 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PcnaP17918 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PcnaP17918 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PcnaP17918 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PcnaP17918 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PcnaP17918 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PcnaP17918 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms