Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Gapdhs-203ENSMUST00000182634 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Slc13a5-206ENSMUST00000208912 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Cdk1-202ENSMUST00000119827 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Gm16030-201ENSMUST00000159098 603 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 9530085P06Rik-201ENSMUST00000182121 827 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 AC124613.1-201ENSMUST00000198711 88 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 AC159282.1-204ENSMUST00000219472 780 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 AC122840.4-201ENSMUST00000221310 1285 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Tcl1b5-201ENSMUST00000000717 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Rnf20-201ENSMUST00000029989 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Tnnt3-213ENSMUST00000105952 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Tnnt3-215ENSMUST00000105954 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Tnnt3-216ENSMUST00000105955 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Tnnt3-218ENSMUST00000105958 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 C130080G10Rik-204ENSMUST00000155185 954 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Gm24294-201ENSMUST00000158295 277 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Mid1-ps1-201ENSMUST00000167967 1248 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Erg-208ENSMUST00000176345 1222 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Tnnt3-225ENSMUST00000179658 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Ighv1-70-201ENSMUST00000196509 351 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Mrpl23-207ENSMUST00000210803 590 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Gm9736-201ENSMUST00000219969 834 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Cenpx-201ENSMUST00000026137 692 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Tnnt3-202ENSMUST00000078497 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Orc4-201ENSMUST00000028098 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Mir453-201ENSMUST00000104732 82 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Cenpx-204ENSMUST00000106155 700 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Fmr1nb-203ENSMUST00000114647 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 St8sia3os-204ENSMUST00000140903 383 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Gm11417-201ENSMUST00000150536 920 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Gm17207-201ENSMUST00000168686 645 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Tnnc1-202ENSMUST00000169169 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Gm38135-201ENSMUST00000195068 502 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Gm43866-201ENSMUST00000203894 839 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 4930546C10Rik-201ENSMUST00000025428 363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Larp1b-204ENSMUST00000099121 1030 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Zc2hc1a-203ENSMUST00000193010 1420 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Nit1-203ENSMUST00000111296 1394 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Fam107b-202ENSMUST00000115052 861 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
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