Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Aff1-202ENSMUST00000054979 8323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Acan-201ENSMUST00000032835 7355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Apobec1-201ENSMUST00000112585 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Trpm2-203ENSMUST00000105401 7274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Fam210a-201ENSMUST00000042852 9651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 4931406C07Rik-201ENSMUST00000034414 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Tbcel-203ENSMUST00000125995 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Pde2a-202ENSMUST00000166652 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Olfr77-202ENSMUST00000217347 5980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Bicral-201ENSMUST00000040624 6579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Olfr463-202ENSMUST00000215150 2031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Ddx3x-201ENSMUST00000000804 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Kif1a-204ENSMUST00000171796 8206 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Pla2g4a-201ENSMUST00000070200 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Sox13-203ENSMUST00000144386 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Abcc4-201ENSMUST00000036554 5715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms