Protein–RNA interactions for Protein: P11725

Otc, Ornithine carbamoyltransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtcP11725 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
OtcP11725 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
OtcP11725 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
OtcP11725 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
OtcP11725 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
OtcP11725 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
OtcP11725 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
OtcP11725 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
OtcP11725 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
OtcP11725 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
OtcP11725 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
OtcP11725 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
OtcP11725 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
OtcP11725 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
OtcP11725 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
OtcP11725 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
OtcP11725 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
OtcP11725 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
OtcP11725 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
OtcP11725 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
OtcP11725 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
OtcP11725 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
OtcP11725 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
OtcP11725 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
OtcP11725 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
OtcP11725 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
OtcP11725 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
OtcP11725 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
OtcP11725 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
OtcP11725 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
OtcP11725 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
OtcP11725 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
OtcP11725 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
OtcP11725 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
OtcP11725 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
OtcP11725 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
OtcP11725 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
OtcP11725 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
OtcP11725 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
OtcP11725 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
OtcP11725 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
OtcP11725 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
OtcP11725 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
OtcP11725 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
OtcP11725 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
OtcP11725 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
OtcP11725 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
OtcP11725 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
OtcP11725 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
OtcP11725 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
OtcP11725 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
OtcP11725 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
OtcP11725 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
OtcP11725 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
OtcP11725 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
OtcP11725 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
OtcP11725 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
OtcP11725 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
OtcP11725 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
OtcP11725 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
OtcP11725 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
OtcP11725 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
OtcP11725 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
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OtcP11725 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
OtcP11725 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
OtcP11725 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
OtcP11725 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
OtcP11725 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
OtcP11725 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
OtcP11725 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
OtcP11725 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
OtcP11725 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
OtcP11725 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
OtcP11725 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
OtcP11725 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
OtcP11725 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
OtcP11725 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
OtcP11725 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
OtcP11725 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
OtcP11725 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
OtcP11725 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
OtcP11725 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
OtcP11725 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
OtcP11725 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
OtcP11725 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
OtcP11725 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
OtcP11725 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
OtcP11725 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
OtcP11725 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
OtcP11725 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
OtcP11725 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
OtcP11725 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
OtcP11725 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
OtcP11725 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
OtcP11725 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
OtcP11725 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
OtcP11725 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
OtcP11725 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms