Protein–RNA interactions for Protein: P05622

Pdgfrb, Platelet-derived growth factor receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrbP05622 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 CT030159.3-201ENSMUST00000222936 1481 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Gm25026-201ENSMUST00000175017 188 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 AC132881.2-201ENSMUST00000225474 709 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Gm16420-201ENSMUST00000120258 856 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Gm37017-201ENSMUST00000195266 747 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Gm43049-202ENSMUST00000198942 559 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 BC028528-202ENSMUST00000090476 809 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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