Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
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H2-Eb1P04230 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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H2-Eb1P04230 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
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H2-Eb1P04230 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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