Protein–RNA interactions for Protein: P04202

Tgfb1, Transforming growth factor beta-1, mousemouse

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Length 390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1P04202 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Gm45657-201ENSMUST00000211318 1349 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Gm16107-201ENSMUST00000162523 862 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 E330011O21Rik-205ENSMUST00000211317 1062 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
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