Protein–RNA interactions for Protein: P01921

H2-Ab1, H-2 class II histocompatibility antigen, A-D beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Ab1P01921 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
H2-Ab1P01921 4933408B17Rik-201ENSMUST00000056932 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
H2-Ab1P01921 Cln3-204ENSMUST00000116269 2487 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
H2-Ab1P01921 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
H2-Ab1P01921 Apobec3-205ENSMUST00000175752 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
H2-Ab1P01921 Ndufs1-203ENSMUST00000168099 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
H2-Ab1P01921 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
H2-Ab1P01921 Med19-201ENSMUST00000102645 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
H2-Ab1P01921 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
H2-Ab1P01921 Morf4l2-212ENSMUST00000164609 1811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 H2-M10.3-201ENSMUST00000073546 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Sorbs3-203ENSMUST00000227653 3061 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Scamp1-203ENSMUST00000152555 1877 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Gm23061-201ENSMUST00000102348 116 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Rxfp2-201ENSMUST00000065745 2539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Pck2-201ENSMUST00000048781 3400 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Gm10643-201ENSMUST00000098592 1577 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Ank2-214ENSMUST00000182547 2428 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Kcne2-202ENSMUST00000113971 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Oas1h-201ENSMUST00000072476 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms