Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.1 ms