Protein–RNA interactions for Protein: O55028

Bckdk, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, mousemouse

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdkO55028 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
BckdkO55028 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
BckdkO55028 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
BckdkO55028 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BckdkO55028 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
BckdkO55028 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
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BckdkO55028 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
BckdkO55028 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BckdkO55028 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
BckdkO55028 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
BckdkO55028 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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