Protein–RNA interactions for Protein: O54836

Zmat3, Zinc finger matrin-type protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zmat3O54836 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Zmat3O54836 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Zmat3O54836 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Zmat3O54836 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Zmat3O54836 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Zmat3O54836 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Zmat3O54836 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Zmat3O54836 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Zmat3O54836 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Zmat3O54836 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Zmat3O54836 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Zmat3O54836 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Zmat3O54836 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Zmat3O54836 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Zmat3O54836 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Zmat3O54836 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Zmat3O54836 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Zmat3O54836 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Zmat3O54836 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Zmat3O54836 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Zmat3O54836 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Zmat3O54836 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Zmat3O54836 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Zmat3O54836 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Zmat3O54836 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Zmat3O54836 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Zmat3O54836 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Zmat3O54836 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Zmat3O54836 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Zmat3O54836 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Zmat3O54836 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Zmat3O54836 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Zmat3O54836 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Zmat3O54836 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Zmat3O54836 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Zmat3O54836 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Zmat3O54836 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Zmat3O54836 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Zmat3O54836 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Zmat3O54836 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Zmat3O54836 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Zmat3O54836 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Zmat3O54836 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Zmat3O54836 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Zmat3O54836 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Zmat3O54836 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Zmat3O54836 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Zmat3O54836 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Zmat3O54836 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Zmat3O54836 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Zmat3O54836 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Zmat3O54836 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Zmat3O54836 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Zmat3O54836 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Zmat3O54836 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Zmat3O54836 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Zmat3O54836 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Zmat3O54836 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Zmat3O54836 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Zmat3O54836 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Zmat3O54836 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Zmat3O54836 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Zmat3O54836 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Zmat3O54836 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Zmat3O54836 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Zmat3O54836 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Zmat3O54836 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Zmat3O54836 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Zmat3O54836 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Zmat3O54836 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Zmat3O54836 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Zmat3O54836 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Zmat3O54836 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Zmat3O54836 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Zmat3O54836 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Zmat3O54836 Gm12940-202ENSMUST00000137236 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Zmat3O54836 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Zmat3O54836 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Zmat3O54836 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Zmat3O54836 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Zmat3O54836 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Zmat3O54836 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Zmat3O54836 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Zmat3O54836 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Zmat3O54836 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Zmat3O54836 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Zmat3O54836 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Zmat3O54836 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Zmat3O54836 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Zmat3O54836 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Zmat3O54836 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Zmat3O54836 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Zmat3O54836 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Zmat3O54836 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Zmat3O54836 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Zmat3O54836 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Zmat3O54836 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Zmat3O54836 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Zmat3O54836 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Zmat3O54836 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.7 ms