Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Schip1-202ENSMUST00000169909 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Tmem237-205ENSMUST00000186794 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Gm22594-201ENSMUST00000104251 130 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Ifitm1-202ENSMUST00000106040 560 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Ifitm1-203ENSMUST00000106042 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Gm14234-201ENSMUST00000119539 845 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Gm14222-201ENSMUST00000128681 575 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Ins2-208ENSMUST00000162317 297 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Gm26976-201ENSMUST00000182929 908 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 1700017I07Rik-201ENSMUST00000184823 462 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Gm8255-201ENSMUST00000218693 305 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Gm7525-201ENSMUST00000219425 454 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 9430078K24Rik-203ENSMUST00000220293 638 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Ifitm1-201ENSMUST00000026564 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Slc13a5-206ENSMUST00000208912 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Mterf3-201ENSMUST00000021991 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Art5-203ENSMUST00000106935 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Nnmt-202ENSMUST00000119426 912 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Gm11502-201ENSMUST00000120917 1211 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Gm4982-201ENSMUST00000160440 1098 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 1700006J14Rik-204ENSMUST00000161511 574 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Zfp637-210ENSMUST00000164472 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Gm25677-201ENSMUST00000174983 72 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Gm28901-201ENSMUST00000188810 474 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Gm34379-201ENSMUST00000195036 290 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Gm42433-201ENSMUST00000196806 940 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 AC134248.1-201ENSMUST00000216113 1176 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 D730050B12Rik-201ENSMUST00000223149 585 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Capsl-202ENSMUST00000226688 739 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Tdpoz3-201ENSMUST00000081780 1098 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Prss55-201ENSMUST00000089338 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Gm11986-201ENSMUST00000149481 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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