Protein–RNA interactions for Protein: O35182

Smad6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad6O35182 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smad6O35182 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smad6O35182 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smad6O35182 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smad6O35182 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smad6O35182 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smad6O35182 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smad6O35182 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Smad6O35182 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smad6O35182 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smad6O35182 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Smad6O35182 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smad6O35182 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smad6O35182 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smad6O35182 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smad6O35182 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smad6O35182 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Smad6O35182 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smad6O35182 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Smad6O35182 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smad6O35182 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smad6O35182 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smad6O35182 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smad6O35182 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smad6O35182 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smad6O35182 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smad6O35182 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smad6O35182 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smad6O35182 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smad6O35182 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Smad6O35182 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Smad6O35182 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Smad6O35182 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smad6O35182 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smad6O35182 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Smad6O35182 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smad6O35182 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Smad6O35182 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Smad6O35182 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smad6O35182 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smad6O35182 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smad6O35182 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Smad6O35182 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smad6O35182 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smad6O35182 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smad6O35182 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smad6O35182 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smad6O35182 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smad6O35182 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smad6O35182 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smad6O35182 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smad6O35182 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smad6O35182 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Smad6O35182 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smad6O35182 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smad6O35182 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smad6O35182 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Smad6O35182 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smad6O35182 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smad6O35182 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smad6O35182 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smad6O35182 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smad6O35182 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smad6O35182 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smad6O35182 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smad6O35182 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smad6O35182 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smad6O35182 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smad6O35182 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smad6O35182 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Smad6O35182 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smad6O35182 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Smad6O35182 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smad6O35182 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smad6O35182 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smad6O35182 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Smad6O35182 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smad6O35182 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smad6O35182 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smad6O35182 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smad6O35182 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smad6O35182 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Smad6O35182 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smad6O35182 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smad6O35182 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smad6O35182 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smad6O35182 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Smad6O35182 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smad6O35182 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smad6O35182 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smad6O35182 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Smad6O35182 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smad6O35182 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smad6O35182 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Smad6O35182 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smad6O35182 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Smad6O35182 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smad6O35182 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
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