Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Casq1O09165 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Casq1O09165 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Gm5420-201ENSMUST00000071008 2206 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Casq1O09165 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Casq1O09165 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Casq1O09165 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Casq1O09165 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Casq1O09165 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
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