Protein–RNA interactions for Protein: F8VQM8

Xntrpc, Xndc1-transient receptor potential cation channel, subfamily C, member 2 readthrough, mousemouse

Predictions only

Length 1,264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XntrpcF8VQM8 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
XntrpcF8VQM8 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
XntrpcF8VQM8 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
XntrpcF8VQM8 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
XntrpcF8VQM8 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
XntrpcF8VQM8 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
XntrpcF8VQM8 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
XntrpcF8VQM8 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
XntrpcF8VQM8 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
XntrpcF8VQM8 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
XntrpcF8VQM8 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
XntrpcF8VQM8 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
XntrpcF8VQM8 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
XntrpcF8VQM8 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
XntrpcF8VQM8 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
XntrpcF8VQM8 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
XntrpcF8VQM8 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
XntrpcF8VQM8 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
XntrpcF8VQM8 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
XntrpcF8VQM8 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
XntrpcF8VQM8 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
XntrpcF8VQM8 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
XntrpcF8VQM8 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
XntrpcF8VQM8 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
XntrpcF8VQM8 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
XntrpcF8VQM8 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
XntrpcF8VQM8 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
XntrpcF8VQM8 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
XntrpcF8VQM8 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
XntrpcF8VQM8 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
XntrpcF8VQM8 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
XntrpcF8VQM8 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
XntrpcF8VQM8 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
XntrpcF8VQM8 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
XntrpcF8VQM8 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
XntrpcF8VQM8 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
XntrpcF8VQM8 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
XntrpcF8VQM8 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
XntrpcF8VQM8 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
XntrpcF8VQM8 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
XntrpcF8VQM8 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
XntrpcF8VQM8 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
XntrpcF8VQM8 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
XntrpcF8VQM8 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
XntrpcF8VQM8 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
XntrpcF8VQM8 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
XntrpcF8VQM8 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
XntrpcF8VQM8 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
XntrpcF8VQM8 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
XntrpcF8VQM8 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
XntrpcF8VQM8 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
XntrpcF8VQM8 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
XntrpcF8VQM8 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
XntrpcF8VQM8 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
XntrpcF8VQM8 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
XntrpcF8VQM8 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
XntrpcF8VQM8 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
XntrpcF8VQM8 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
XntrpcF8VQM8 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
XntrpcF8VQM8 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
XntrpcF8VQM8 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
XntrpcF8VQM8 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
XntrpcF8VQM8 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
XntrpcF8VQM8 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
XntrpcF8VQM8 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
XntrpcF8VQM8 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
XntrpcF8VQM8 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
XntrpcF8VQM8 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
XntrpcF8VQM8 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
XntrpcF8VQM8 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
XntrpcF8VQM8 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
XntrpcF8VQM8 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
XntrpcF8VQM8 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
XntrpcF8VQM8 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
XntrpcF8VQM8 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
XntrpcF8VQM8 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
XntrpcF8VQM8 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
XntrpcF8VQM8 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
XntrpcF8VQM8 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
XntrpcF8VQM8 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
XntrpcF8VQM8 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
XntrpcF8VQM8 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
XntrpcF8VQM8 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
XntrpcF8VQM8 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
XntrpcF8VQM8 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
XntrpcF8VQM8 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
XntrpcF8VQM8 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
XntrpcF8VQM8 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
XntrpcF8VQM8 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
XntrpcF8VQM8 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
XntrpcF8VQM8 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
XntrpcF8VQM8 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
XntrpcF8VQM8 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
XntrpcF8VQM8 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
XntrpcF8VQM8 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
XntrpcF8VQM8 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
XntrpcF8VQM8 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
XntrpcF8VQM8 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
XntrpcF8VQM8 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
XntrpcF8VQM8 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms