Protein–RNA interactions for Protein: F6VKC7

Zfp988, Zinc finger protein 988, mousemouse

Predictions only

Length 633 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp988F6VKC7 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Zfp988F6VKC7 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Zfp988F6VKC7 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Zfp988F6VKC7 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Zfp988F6VKC7 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Zfp988F6VKC7 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Zfp988F6VKC7 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Zfp988F6VKC7 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Zfp988F6VKC7 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Zfp988F6VKC7 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Zfp988F6VKC7 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Zfp988F6VKC7 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Zfp988F6VKC7 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Zfp988F6VKC7 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Zfp988F6VKC7 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Zfp988F6VKC7 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Zfp988F6VKC7 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Zfp988F6VKC7 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Zfp988F6VKC7 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Zfp988F6VKC7 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Zfp988F6VKC7 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Zfp988F6VKC7 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Zfp988F6VKC7 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Zfp988F6VKC7 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Zfp988F6VKC7 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Zfp988F6VKC7 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Zfp988F6VKC7 Umad1-201ENSMUST00000159168 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Zfp988F6VKC7 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Zfp988F6VKC7 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Zfp988F6VKC7 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Zfp988F6VKC7 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Zfp988F6VKC7 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Zfp988F6VKC7 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Zfp988F6VKC7 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Zfp988F6VKC7 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Zfp988F6VKC7 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Zfp988F6VKC7 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Zfp988F6VKC7 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Zfp988F6VKC7 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Zfp988F6VKC7 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Zfp988F6VKC7 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Zfp988F6VKC7 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Zfp988F6VKC7 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Zfp988F6VKC7 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Zfp988F6VKC7 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Zfp988F6VKC7 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Zfp988F6VKC7 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Zfp988F6VKC7 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Zfp988F6VKC7 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Zfp988F6VKC7 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Zfp988F6VKC7 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Zfp988F6VKC7 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Zfp988F6VKC7 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Zfp988F6VKC7 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Zfp988F6VKC7 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Zfp988F6VKC7 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Zfp988F6VKC7 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Zfp988F6VKC7 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Zfp988F6VKC7 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Zfp988F6VKC7 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Zfp988F6VKC7 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Zfp988F6VKC7 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Zfp988F6VKC7 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Zfp988F6VKC7 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Zfp988F6VKC7 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Zfp988F6VKC7 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Zfp988F6VKC7 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Zfp988F6VKC7 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Zfp988F6VKC7 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Zfp988F6VKC7 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Zfp988F6VKC7 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Zfp988F6VKC7 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Zfp988F6VKC7 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Zfp988F6VKC7 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Zfp988F6VKC7 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Zfp988F6VKC7 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Zfp988F6VKC7 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Zfp988F6VKC7 Olfr463-202ENSMUST00000215150 2031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Zfp988F6VKC7 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Zfp988F6VKC7 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Zfp988F6VKC7 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Zfp988F6VKC7 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Zfp988F6VKC7 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Zfp988F6VKC7 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Zfp988F6VKC7 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Zfp988F6VKC7 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Zfp988F6VKC7 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Zfp988F6VKC7 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Zfp988F6VKC7 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Zfp988F6VKC7 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Zfp988F6VKC7 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Zfp988F6VKC7 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Zfp988F6VKC7 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Zfp988F6VKC7 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Zfp988F6VKC7 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Zfp988F6VKC7 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Zfp988F6VKC7 Pla2g4a-201ENSMUST00000070200 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Zfp988F6VKC7 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Zfp988F6VKC7 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Zfp988F6VKC7 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms