Protein–RNA interactions for Protein: E9QAP7

Taf4, TATA-box-binding protein-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4E9QAP7 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Taf4E9QAP7 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Taf4E9QAP7 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Taf4E9QAP7 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Taf4E9QAP7 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Taf4E9QAP7 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Taf4E9QAP7 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Taf4E9QAP7 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Taf4E9QAP7 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Taf4E9QAP7 Mecomos-201ENSMUST00000125611 5510 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Taf4E9QAP7 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Taf4E9QAP7 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Taf4E9QAP7 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Taf4E9QAP7 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Taf4E9QAP7 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Taf4E9QAP7 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Taf4E9QAP7 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Taf4E9QAP7 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Taf4E9QAP7 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Taf4E9QAP7 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Taf4E9QAP7 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Taf4E9QAP7 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Taf4E9QAP7 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Taf4E9QAP7 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Taf4E9QAP7 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Taf4E9QAP7 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Taf4E9QAP7 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Taf4E9QAP7 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Taf4E9QAP7 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Taf4E9QAP7 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Taf4E9QAP7 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Taf4E9QAP7 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Taf4E9QAP7 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Taf4E9QAP7 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Taf4E9QAP7 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Taf4E9QAP7 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Taf4E9QAP7 Fbln2-202ENSMUST00000113498 4644 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Taf4E9QAP7 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Taf4E9QAP7 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Taf4E9QAP7 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Taf4E9QAP7 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Taf4E9QAP7 Cit-212ENSMUST00000141101 6794 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Taf4E9QAP7 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Taf4E9QAP7 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Taf4E9QAP7 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Taf4E9QAP7 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Taf4E9QAP7 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Taf4E9QAP7 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Taf4E9QAP7 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Taf4E9QAP7 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Taf4E9QAP7 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Taf4E9QAP7 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Taf4E9QAP7 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Taf4E9QAP7 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Taf4E9QAP7 Xirp1-201ENSMUST00000111635 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Taf4E9QAP7 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Taf4E9QAP7 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Taf4E9QAP7 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Taf4E9QAP7 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Taf4E9QAP7 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Taf4E9QAP7 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Taf4E9QAP7 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Taf4E9QAP7 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Taf4E9QAP7 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Taf4E9QAP7 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Taf4E9QAP7 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Taf4E9QAP7 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Taf4E9QAP7 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Taf4E9QAP7 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Taf4E9QAP7 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Taf4E9QAP7 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Taf4E9QAP7 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Taf4E9QAP7 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Taf4E9QAP7 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Taf4E9QAP7 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Taf4E9QAP7 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Taf4E9QAP7 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Taf4E9QAP7 Bcap31-201ENSMUST00000002091 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Taf4E9QAP7 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Taf4E9QAP7 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Taf4E9QAP7 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Taf4E9QAP7 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Taf4E9QAP7 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Taf4E9QAP7 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Taf4E9QAP7 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Taf4E9QAP7 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Taf4E9QAP7 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Taf4E9QAP7 Rab3gap2-201ENSMUST00000069652 7052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Taf4E9QAP7 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Taf4E9QAP7 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Taf4E9QAP7 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Taf4E9QAP7 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Taf4E9QAP7 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Taf4E9QAP7 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Taf4E9QAP7 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Taf4E9QAP7 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Taf4E9QAP7 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Taf4E9QAP7 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Taf4E9QAP7 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Taf4E9QAP7 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 128.8 ms