Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

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Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Mphosph10-201ENSMUST00000032735 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Gm11986-201ENSMUST00000149481 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Pax5-205ENSMUST00000107827 1315 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Znrd1-202ENSMUST00000172518 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Gm9507-202ENSMUST00000180157 654 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Tcf25-210ENSMUST00000212880 827 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Gm40879-201ENSMUST00000220759 612 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 D730050B12Rik-201ENSMUST00000223149 585 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 AC115304.2-201ENSMUST00000226399 332 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Prss55-201ENSMUST00000089338 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Slc13a5-206ENSMUST00000208912 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Gm26632-201ENSMUST00000181120 1400 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Zw10-201ENSMUST00000034803 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Gm22594-201ENSMUST00000104251 130 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 1700001C02Rik-202ENSMUST00000114743 729 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Syngr4-202ENSMUST00000120299 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Kdm6bos-201ENSMUST00000129924 840 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Nudt7-204ENSMUST00000134593 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Pax4-202ENSMUST00000164519 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Pax4-203ENSMUST00000171089 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Gm23400-201ENSMUST00000174994 102 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Gm26463-201ENSMUST00000175065 101 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Gm24332-201ENSMUST00000175102 102 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Gm25959-201ENSMUST00000175112 102 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Gm22475-201ENSMUST00000175169 102 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Gm22903-201ENSMUST00000175193 102 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Gm25070-201ENSMUST00000175237 102 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Gm24159-201ENSMUST00000175264 102 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Gm25299-201ENSMUST00000175283 102 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Gm23798-201ENSMUST00000175560 102 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Gm23802-201ENSMUST00000175565 102 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Gm25708-201ENSMUST00000177687 102 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Gm24370-201ENSMUST00000178007 102 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Gm23049-201ENSMUST00000178068 102 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Gm28019-201ENSMUST00000178138 101 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Scgb2b7-201ENSMUST00000178258 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Gm25571-201ENSMUST00000178322 102 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Gm25355-201ENSMUST00000178456 101 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Gm24975-201ENSMUST00000178492 101 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Gm23189-201ENSMUST00000178954 102 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Gm25100-201ENSMUST00000179750 101 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Gm23064-201ENSMUST00000179866 101 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 4732414G09Rik-202ENSMUST00000180695 408 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Gm9102-201ENSMUST00000219250 465 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 CT030166.5-201ENSMUST00000222249 420 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Spink2-201ENSMUST00000065216 631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Naca-201ENSMUST00000073868 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Olfr525-201ENSMUST00000078103 1050 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Hist1h2bl-201ENSMUST00000091756 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
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