Protein–RNA interactions for Protein: B2RQG2

Phf3, PHD finger protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,025 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf3B2RQG2 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Phf3B2RQG2 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Phf3B2RQG2 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Phf3B2RQG2 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Phf3B2RQG2 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Phf3B2RQG2 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Phf3B2RQG2 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Phf3B2RQG2 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Phf3B2RQG2 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Phf3B2RQG2 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Phf3B2RQG2 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Phf3B2RQG2 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Phf3B2RQG2 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Phf3B2RQG2 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Phf3B2RQG2 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phf3B2RQG2 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phf3B2RQG2 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phf3B2RQG2 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phf3B2RQG2 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Phf3B2RQG2 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phf3B2RQG2 Gm12969-201ENSMUST00000120199 1004 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Phf3B2RQG2 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Phf3B2RQG2 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phf3B2RQG2 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phf3B2RQG2 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phf3B2RQG2 Gm15524-201ENSMUST00000159874 463 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phf3B2RQG2 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Phf3B2RQG2 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phf3B2RQG2 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Phf3B2RQG2 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Phf3B2RQG2 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Phf3B2RQG2 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phf3B2RQG2 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phf3B2RQG2 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phf3B2RQG2 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phf3B2RQG2 4930465M20Rik-201ENSMUST00000130564 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phf3B2RQG2 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Phf3B2RQG2 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phf3B2RQG2 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phf3B2RQG2 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Phf3B2RQG2 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phf3B2RQG2 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phf3B2RQG2 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phf3B2RQG2 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phf3B2RQG2 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Phf3B2RQG2 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phf3B2RQG2 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phf3B2RQG2 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phf3B2RQG2 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phf3B2RQG2 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phf3B2RQG2 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phf3B2RQG2 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phf3B2RQG2 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phf3B2RQG2 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phf3B2RQG2 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phf3B2RQG2 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phf3B2RQG2 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phf3B2RQG2 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phf3B2RQG2 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phf3B2RQG2 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phf3B2RQG2 Gm16081-201ENSMUST00000155992 684 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phf3B2RQG2 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phf3B2RQG2 Gm17070-201ENSMUST00000170463 784 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Phf3B2RQG2 Nudt12-203ENSMUST00000174122 1244 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phf3B2RQG2 Gm19587-201ENSMUST00000191395 545 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Phf3B2RQG2 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Phf3B2RQG2 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phf3B2RQG2 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phf3B2RQG2 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phf3B2RQG2 Gm44647-201ENSMUST00000207402 428 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Phf3B2RQG2 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Phf3B2RQG2 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Phf3B2RQG2 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phf3B2RQG2 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phf3B2RQG2 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phf3B2RQG2 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phf3B2RQG2 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Phf3B2RQG2 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phf3B2RQG2 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Phf3B2RQG2 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Phf3B2RQG2 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Phf3B2RQG2 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Phf3B2RQG2 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Phf3B2RQG2 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Phf3B2RQG2 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Phf3B2RQG2 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Phf3B2RQG2 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Phf3B2RQG2 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Phf3B2RQG2 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Phf3B2RQG2 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Phf3B2RQG2 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Phf3B2RQG2 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Phf3B2RQG2 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Phf3B2RQG2 Prr33-202ENSMUST00000151580 399 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Phf3B2RQG2 BC016548-202ENSMUST00000153797 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Phf3B2RQG2 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Phf3B2RQG2 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Phf3B2RQG2 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Phf3B2RQG2 Gm18204-201ENSMUST00000209835 793 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Phf3B2RQG2 Gm4924-205ENSMUST00000211099 490 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms