Protein–RNA interactions for Protein: A7TZF3

Skint4, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint4A7TZF3 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Skint4A7TZF3 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Skint4A7TZF3 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Skint4A7TZF3 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Skint4A7TZF3 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Skint4A7TZF3 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Skint4A7TZF3 AC125070.1-201ENSMUST00000223523 555 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Skint4A7TZF3 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Skint4A7TZF3 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Skint4A7TZF3 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Skint4A7TZF3 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Skint4A7TZF3 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Skint4A7TZF3 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Skint4A7TZF3 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Skint4A7TZF3 Gm30648-202ENSMUST00000200648 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Skint4A7TZF3 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Skint4A7TZF3 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Skint4A7TZF3 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Skint4A7TZF3 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Skint4A7TZF3 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Skint4A7TZF3 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Skint4A7TZF3 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Skint4A7TZF3 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Skint4A7TZF3 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Skint4A7TZF3 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Skint4A7TZF3 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Skint4A7TZF3 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Skint4A7TZF3 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Skint4A7TZF3 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Skint4A7TZF3 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Skint4A7TZF3 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Skint4A7TZF3 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Skint4A7TZF3 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Skint4A7TZF3 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Skint4A7TZF3 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Skint4A7TZF3 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Skint4A7TZF3 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Skint4A7TZF3 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Skint4A7TZF3 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Skint4A7TZF3 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Skint4A7TZF3 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Skint4A7TZF3 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Skint4A7TZF3 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Skint4A7TZF3 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Skint4A7TZF3 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Skint4A7TZF3 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Skint4A7TZF3 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Skint4A7TZF3 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Skint4A7TZF3 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Skint4A7TZF3 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Skint4A7TZF3 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Skint4A7TZF3 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Skint4A7TZF3 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Skint4A7TZF3 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Skint4A7TZF3 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Skint4A7TZF3 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Skint4A7TZF3 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Skint4A7TZF3 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Skint4A7TZF3 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Skint4A7TZF3 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Skint4A7TZF3 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Skint4A7TZF3 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Skint4A7TZF3 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Skint4A7TZF3 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Skint4A7TZF3 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Skint4A7TZF3 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Skint4A7TZF3 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Skint4A7TZF3 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Skint4A7TZF3 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Skint4A7TZF3 Dnmbp-206ENSMUST00000212592 3901 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Skint4A7TZF3 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Skint4A7TZF3 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Skint4A7TZF3 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Skint4A7TZF3 Faim2-201ENSMUST00000023750 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Skint4A7TZF3 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Skint4A7TZF3 Slc17a5-201ENSMUST00000052441 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Skint4A7TZF3 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Skint4A7TZF3 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Skint4A7TZF3 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Skint4A7TZF3 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Skint4A7TZF3 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Skint4A7TZF3 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Skint4A7TZF3 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Skint4A7TZF3 Tfam-201ENSMUST00000092430 4167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Skint4A7TZF3 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Skint4A7TZF3 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Skint4A7TZF3 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Skint4A7TZF3 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Skint4A7TZF3 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Skint4A7TZF3 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Skint4A7TZF3 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Skint4A7TZF3 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Skint4A7TZF3 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Skint4A7TZF3 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Skint4A7TZF3 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Skint4A7TZF3 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Skint4A7TZF3 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Skint4A7TZF3 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Skint4A7TZF3 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Skint4A7TZF3 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms