Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Atp8b5A3FIN4 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Atp8b5A3FIN4 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Atp8b5A3FIN4 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Atp8b5A3FIN4 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Atp8b5A3FIN4 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Atp8b5A3FIN4 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Atp8b5A3FIN4 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Atp8b5A3FIN4 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Atp8b5A3FIN4 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Atp8b5A3FIN4 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Atp8b5A3FIN4 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Atp8b5A3FIN4 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Atp8b5A3FIN4 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Atp8b5A3FIN4 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Atp8b5A3FIN4 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Atp8b5A3FIN4 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Atp8b5A3FIN4 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Atp8b5A3FIN4 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Atp8b5A3FIN4 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Atp8b5A3FIN4 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Atp8b5A3FIN4 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Atp8b5A3FIN4 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Atp8b5A3FIN4 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Atp8b5A3FIN4 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Atp8b5A3FIN4 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Atp8b5A3FIN4 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Atp8b5A3FIN4 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Atp8b5A3FIN4 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Atp8b5A3FIN4 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Atp8b5A3FIN4 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Atp8b5A3FIN4 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Atp8b5A3FIN4 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Atp8b5A3FIN4 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Atp8b5A3FIN4 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Atp8b5A3FIN4 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Atp8b5A3FIN4 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Atp8b5A3FIN4 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Atp8b5A3FIN4 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Atp8b5A3FIN4 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Atp8b5A3FIN4 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Atp8b5A3FIN4 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Atp8b5A3FIN4 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Atp8b5A3FIN4 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Atp8b5A3FIN4 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Atp8b5A3FIN4 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Atp8b5A3FIN4 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Atp8b5A3FIN4 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Atp8b5A3FIN4 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Atp8b5A3FIN4 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Atp8b5A3FIN4 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Atp8b5A3FIN4 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Atp8b5A3FIN4 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Atp8b5A3FIN4 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Atp8b5A3FIN4 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Atp8b5A3FIN4 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Atp8b5A3FIN4 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Atp8b5A3FIN4 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Atp8b5A3FIN4 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Atp8b5A3FIN4 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
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Atp8b5A3FIN4 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atp8b5A3FIN4 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atp8b5A3FIN4 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atp8b5A3FIN4 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atp8b5A3FIN4 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atp8b5A3FIN4 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atp8b5A3FIN4 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atp8b5A3FIN4 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atp8b5A3FIN4 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atp8b5A3FIN4 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Atp8b5A3FIN4 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atp8b5A3FIN4 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Atp8b5A3FIN4 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Atp8b5A3FIN4 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Atp8b5A3FIN4 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atp8b5A3FIN4 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Atp8b5A3FIN4 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Atp8b5A3FIN4 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atp8b5A3FIN4 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atp8b5A3FIN4 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Atp8b5A3FIN4 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atp8b5A3FIN4 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atp8b5A3FIN4 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atp8b5A3FIN4 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Atp8b5A3FIN4 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atp8b5A3FIN4 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atp8b5A3FIN4 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Atp8b5A3FIN4 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atp8b5A3FIN4 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Atp8b5A3FIN4 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atp8b5A3FIN4 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atp8b5A3FIN4 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Atp8b5A3FIN4 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Atp8b5A3FIN4 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms