Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Phf21a-202ENSMUST00000068702 6023 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Zbtb21-203ENSMUST00000113734 6010 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Gria4-202ENSMUST00000063508 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Mthfr-201ENSMUST00000069604 6072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Flna-201ENSMUST00000033699 8312 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Rtl1-201ENSMUST00000149046 6358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms