Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Atp9b-201ENSMUST00000091790 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Cacna2d4-201ENSMUST00000037434 5803 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Adcy8-202ENSMUST00000228014 6900 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Cmya5-201ENSMUST00000062122 11850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Kif4-201ENSMUST00000048962 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Kalrn-205ENSMUST00000114953 4722 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms