Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms