Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E2

Mbd1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd1Q9Z2E2 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms