Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Dab2-203ENSMUST00000110663 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Mbd3Q9Z2D8 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Mbd3Q9Z2D8 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Mbd3Q9Z2D8 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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