Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z140

Cpne6, Copine-6, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne6Q9Z140 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cpne6Q9Z140 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cpne6Q9Z140 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cpne6Q9Z140 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cpne6Q9Z140 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cpne6Q9Z140 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cpne6Q9Z140 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cpne6Q9Z140 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cpne6Q9Z140 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Cpne6Q9Z140 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cpne6Q9Z140 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cpne6Q9Z140 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cpne6Q9Z140 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cpne6Q9Z140 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cpne6Q9Z140 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cpne6Q9Z140 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cpne6Q9Z140 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cpne6Q9Z140 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cpne6Q9Z140 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cpne6Q9Z140 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cpne6Q9Z140 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cpne6Q9Z140 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cpne6Q9Z140 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Cpne6Q9Z140 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Cpne6Q9Z140 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cpne6Q9Z140 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Cpne6Q9Z140 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cpne6Q9Z140 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cpne6Q9Z140 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cpne6Q9Z140 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cpne6Q9Z140 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cpne6Q9Z140 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Cpne6Q9Z140 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Cpne6Q9Z140 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cpne6Q9Z140 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cpne6Q9Z140 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cpne6Q9Z140 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cpne6Q9Z140 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cpne6Q9Z140 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cpne6Q9Z140 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cpne6Q9Z140 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cpne6Q9Z140 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cpne6Q9Z140 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cpne6Q9Z140 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cpne6Q9Z140 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cpne6Q9Z140 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cpne6Q9Z140 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cpne6Q9Z140 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cpne6Q9Z140 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cpne6Q9Z140 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cpne6Q9Z140 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cpne6Q9Z140 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cpne6Q9Z140 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cpne6Q9Z140 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Cpne6Q9Z140 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cpne6Q9Z140 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cpne6Q9Z140 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cpne6Q9Z140 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cpne6Q9Z140 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cpne6Q9Z140 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cpne6Q9Z140 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Cpne6Q9Z140 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cpne6Q9Z140 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Cpne6Q9Z140 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cpne6Q9Z140 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Cpne6Q9Z140 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cpne6Q9Z140 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cpne6Q9Z140 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Cpne6Q9Z140 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Cpne6Q9Z140 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cpne6Q9Z140 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cpne6Q9Z140 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cpne6Q9Z140 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cpne6Q9Z140 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cpne6Q9Z140 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cpne6Q9Z140 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Cpne6Q9Z140 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cpne6Q9Z140 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cpne6Q9Z140 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Cpne6Q9Z140 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cpne6Q9Z140 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cpne6Q9Z140 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cpne6Q9Z140 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cpne6Q9Z140 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cpne6Q9Z140 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cpne6Q9Z140 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cpne6Q9Z140 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cpne6Q9Z140 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cpne6Q9Z140 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cpne6Q9Z140 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cpne6Q9Z140 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cpne6Q9Z140 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cpne6Q9Z140 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cpne6Q9Z140 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cpne6Q9Z140 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cpne6Q9Z140 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cpne6Q9Z140 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cpne6Q9Z140 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cpne6Q9Z140 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cpne6Q9Z140 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms