Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms