Protein–RNA interactions for Protein: Q9R233

Tapbp, Tapasin, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TapbpQ9R233 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
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TapbpQ9R233 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
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TapbpQ9R233 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
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TapbpQ9R233 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
TapbpQ9R233 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
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TapbpQ9R233 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
TapbpQ9R233 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
TapbpQ9R233 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
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TapbpQ9R233 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
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TapbpQ9R233 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
TapbpQ9R233 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
TapbpQ9R233 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
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TapbpQ9R233 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
TapbpQ9R233 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
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TapbpQ9R233 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
TapbpQ9R233 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TapbpQ9R233 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
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TapbpQ9R233 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TapbpQ9R233 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TapbpQ9R233 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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TapbpQ9R233 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TapbpQ9R233 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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TapbpQ9R233 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TapbpQ9R233 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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TapbpQ9R233 Apobec1-201ENSMUST00000112585 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TapbpQ9R233 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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TapbpQ9R233 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TapbpQ9R233 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TapbpQ9R233 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TapbpQ9R233 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TapbpQ9R233 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TapbpQ9R233 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TapbpQ9R233 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TapbpQ9R233 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TapbpQ9R233 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TapbpQ9R233 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TapbpQ9R233 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TapbpQ9R233 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TapbpQ9R233 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TapbpQ9R233 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
TapbpQ9R233 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TapbpQ9R233 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
TapbpQ9R233 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TapbpQ9R233 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
TapbpQ9R233 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TapbpQ9R233 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TapbpQ9R233 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
TapbpQ9R233 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TapbpQ9R233 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TapbpQ9R233 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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