Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 Sgcz-201ENSMUST00000118896 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 Dhcr7-211ENSMUST00000207143 1652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 Spata33-207ENSMUST00000212760 4074 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 Oprm1-204ENSMUST00000063036 1427 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 Kansl1-201ENSMUST00000018556 5061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 Ttc23-201ENSMUST00000032774 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 Tnk2-207ENSMUST00000115126 4358 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 Dnmbp-206ENSMUST00000212592 3901 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 C130060K24Rik-203ENSMUST00000170608 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 Olfr315-202ENSMUST00000203256 2458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 Tank-204ENSMUST00000112501 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 Map4-204ENSMUST00000164930 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 Kdm4a-204ENSMUST00000106406 4663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 Dglucy-204ENSMUST00000110073 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 Gm45140-202ENSMUST00000204419 5061 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 Pde4c-202ENSMUST00000110095 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 Ddx3x-201ENSMUST00000000804 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 Oprm1-230ENSMUST00000154906 2039 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 Gtf3c2-201ENSMUST00000088010 4552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 Fos-201ENSMUST00000021674 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 Madd-204ENSMUST00000077941 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 Madd-205ENSMUST00000099723 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 Nrg1-213ENSMUST00000208617 2787 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 Rab3gap2-201ENSMUST00000069652 7052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 Gfm2-201ENSMUST00000022170 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 Cfb-207ENSMUST00000176203 2733 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 Fbrs-201ENSMUST00000048896 2650 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms