Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Gm20414-201ENSMUST00000172918 646 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Pet100-203ENSMUST00000207389 363 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Id2-203ENSMUST00000222667 958 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Mterf3-201ENSMUST00000021991 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 4930507D10Rik-201ENSMUST00000137411 1152 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 AC130477.1-201ENSMUST00000226982 420 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Creb3l4-201ENSMUST00000029547 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Oprm1-208ENSMUST00000092734 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 4932431P20Rik-201ENSMUST00000098602 1340 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Gm9133-201ENSMUST00000118289 540 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 AC164429.1-201ENSMUST00000224210 518 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Socs6-202ENSMUST00000123826 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Uqcc1-202ENSMUST00000109631 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Fmr1nb-203ENSMUST00000114647 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
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