Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
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Usp29Q9ES63 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
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Usp29Q9ES63 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
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Usp29Q9ES63 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
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