Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQR3

Kcnn1, Small conductance calcium-activated potassium channel protein 1, mousemouse

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Length 537 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnn1Q9EQR3 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 AC134414.1-201ENSMUST00000228499 1221 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Olfr181-201ENSMUST00000075361 1391 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Pfn4-201ENSMUST00000020967 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Serpina3a-202ENSMUST00000109965 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Gm12598-201ENSMUST00000117333 830 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Gm12948-201ENSMUST00000119406 682 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Plgrkt-208ENSMUST00000143467 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Gm15956-201ENSMUST00000153352 502 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Fasl-202ENSMUST00000193648 406 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Gm43460-201ENSMUST00000202491 1057 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Gm44410-201ENSMUST00000203151 341 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Gm19640-201ENSMUST00000214849 464 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Ntf3-203ENSMUST00000204542 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Gm5605-201ENSMUST00000208940 1305 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Gm11470-201ENSMUST00000118868 1475 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Gm14388-201ENSMUST00000118119 477 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Gm14356-201ENSMUST00000118322 869 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Gm15103-201ENSMUST00000119893 871 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Mir1898-201ENSMUST00000122643 83 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms