Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Clstn1Q9EPL2 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Clstn1Q9EPL2 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Clstn1Q9EPL2 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Clstn1Q9EPL2 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Clstn1Q9EPL2 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Clstn1Q9EPL2 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Clstn1Q9EPL2 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Clstn1Q9EPL2 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Clstn1Q9EPL2 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Clstn1Q9EPL2 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Clstn1Q9EPL2 Adgrl3-215ENSMUST00000120673 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Clstn1Q9EPL2 Crocc2-201ENSMUST00000138595 7132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Clstn1Q9EPL2 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Clstn1Q9EPL2 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Clstn1Q9EPL2 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Clstn1Q9EPL2 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Clstn1Q9EPL2 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Clstn1Q9EPL2 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Clstn1Q9EPL2 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Clstn1Q9EPL2 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Clstn1Q9EPL2 Adcy7-202ENSMUST00000168545 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Clstn1Q9EPL2 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Clstn1Q9EPL2 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Clstn1Q9EPL2 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Clstn1Q9EPL2 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Clstn1Q9EPL2 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Clstn1Q9EPL2 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Clstn1Q9EPL2 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Clstn1Q9EPL2 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Clstn1Q9EPL2 Cts7-201ENSMUST00000021892 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Clstn1Q9EPL2 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Clstn1Q9EPL2 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Clstn1Q9EPL2 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Clstn1Q9EPL2 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Clstn1Q9EPL2 Svil-211ENSMUST00000143254 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Clstn1Q9EPL2 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Clstn1Q9EPL2 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Clstn1Q9EPL2 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Clstn1Q9EPL2 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Clstn1Q9EPL2 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Clstn1Q9EPL2 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Clstn1Q9EPL2 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Clstn1Q9EPL2 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Clstn1Q9EPL2 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Clstn1Q9EPL2 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Clstn1Q9EPL2 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Clstn1Q9EPL2 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Clstn1Q9EPL2 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Clstn1Q9EPL2 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Clstn1Q9EPL2 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Clstn1Q9EPL2 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Clstn1Q9EPL2 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Clstn1Q9EPL2 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Clstn1Q9EPL2 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Clstn1Q9EPL2 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Clstn1Q9EPL2 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Clstn1Q9EPL2 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Clstn1Q9EPL2 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Clstn1Q9EPL2 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Clstn1Q9EPL2 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Clstn1Q9EPL2 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Clstn1Q9EPL2 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Clstn1Q9EPL2 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Clstn1Q9EPL2 Phf8-211ENSMUST00000168501 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Clstn1Q9EPL2 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Clstn1Q9EPL2 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Clstn1Q9EPL2 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Clstn1Q9EPL2 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Clstn1Q9EPL2 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Clstn1Q9EPL2 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Clstn1Q9EPL2 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Clstn1Q9EPL2 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Clstn1Q9EPL2 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Clstn1Q9EPL2 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Clstn1Q9EPL2 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Clstn1Q9EPL2 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Clstn1Q9EPL2 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clstn1Q9EPL2 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clstn1Q9EPL2 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Clstn1Q9EPL2 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clstn1Q9EPL2 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clstn1Q9EPL2 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clstn1Q9EPL2 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clstn1Q9EPL2 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clstn1Q9EPL2 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clstn1Q9EPL2 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clstn1Q9EPL2 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clstn1Q9EPL2 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clstn1Q9EPL2 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clstn1Q9EPL2 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Clstn1Q9EPL2 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clstn1Q9EPL2 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clstn1Q9EPL2 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clstn1Q9EPL2 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clstn1Q9EPL2 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clstn1Q9EPL2 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clstn1Q9EPL2 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clstn1Q9EPL2 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clstn1Q9EPL2 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms