Protein–RNA interactions for Protein: Q9EP64

Tnmd, Tenomodulin, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnmdQ9EP64 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TnmdQ9EP64 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TnmdQ9EP64 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TnmdQ9EP64 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TnmdQ9EP64 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TnmdQ9EP64 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TnmdQ9EP64 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TnmdQ9EP64 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TnmdQ9EP64 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TnmdQ9EP64 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TnmdQ9EP64 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TnmdQ9EP64 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TnmdQ9EP64 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TnmdQ9EP64 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TnmdQ9EP64 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TnmdQ9EP64 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TnmdQ9EP64 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TnmdQ9EP64 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TnmdQ9EP64 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TnmdQ9EP64 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TnmdQ9EP64 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TnmdQ9EP64 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TnmdQ9EP64 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TnmdQ9EP64 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TnmdQ9EP64 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TnmdQ9EP64 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TnmdQ9EP64 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TnmdQ9EP64 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TnmdQ9EP64 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TnmdQ9EP64 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TnmdQ9EP64 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TnmdQ9EP64 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TnmdQ9EP64 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TnmdQ9EP64 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TnmdQ9EP64 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TnmdQ9EP64 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TnmdQ9EP64 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TnmdQ9EP64 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TnmdQ9EP64 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TnmdQ9EP64 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TnmdQ9EP64 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TnmdQ9EP64 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TnmdQ9EP64 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TnmdQ9EP64 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TnmdQ9EP64 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TnmdQ9EP64 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TnmdQ9EP64 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TnmdQ9EP64 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TnmdQ9EP64 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TnmdQ9EP64 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TnmdQ9EP64 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TnmdQ9EP64 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TnmdQ9EP64 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TnmdQ9EP64 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TnmdQ9EP64 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TnmdQ9EP64 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TnmdQ9EP64 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TnmdQ9EP64 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TnmdQ9EP64 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TnmdQ9EP64 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TnmdQ9EP64 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TnmdQ9EP64 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TnmdQ9EP64 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TnmdQ9EP64 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TnmdQ9EP64 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TnmdQ9EP64 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TnmdQ9EP64 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TnmdQ9EP64 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TnmdQ9EP64 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TnmdQ9EP64 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TnmdQ9EP64 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TnmdQ9EP64 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TnmdQ9EP64 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TnmdQ9EP64 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TnmdQ9EP64 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TnmdQ9EP64 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TnmdQ9EP64 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TnmdQ9EP64 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TnmdQ9EP64 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TnmdQ9EP64 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TnmdQ9EP64 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TnmdQ9EP64 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TnmdQ9EP64 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TnmdQ9EP64 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TnmdQ9EP64 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TnmdQ9EP64 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TnmdQ9EP64 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TnmdQ9EP64 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TnmdQ9EP64 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TnmdQ9EP64 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TnmdQ9EP64 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TnmdQ9EP64 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TnmdQ9EP64 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TnmdQ9EP64 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TnmdQ9EP64 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TnmdQ9EP64 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TnmdQ9EP64 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TnmdQ9EP64 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TnmdQ9EP64 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TnmdQ9EP64 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms