Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCU6

Mrpl4, 39S ribosomal protein L4, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl4Q9DCU6 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mrpl4Q9DCU6 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mrpl4Q9DCU6 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mrpl4Q9DCU6 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mrpl4Q9DCU6 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mrpl4Q9DCU6 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mrpl4Q9DCU6 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mrpl4Q9DCU6 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mrpl4Q9DCU6 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mrpl4Q9DCU6 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mrpl4Q9DCU6 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mrpl4Q9DCU6 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Mrpl4Q9DCU6 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl4Q9DCU6 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl4Q9DCU6 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl4Q9DCU6 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl4Q9DCU6 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl4Q9DCU6 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl4Q9DCU6 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl4Q9DCU6 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl4Q9DCU6 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl4Q9DCU6 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl4Q9DCU6 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl4Q9DCU6 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl4Q9DCU6 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl4Q9DCU6 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl4Q9DCU6 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl4Q9DCU6 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl4Q9DCU6 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl4Q9DCU6 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl4Q9DCU6 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl4Q9DCU6 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl4Q9DCU6 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl4Q9DCU6 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl4Q9DCU6 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl4Q9DCU6 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl4Q9DCU6 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl4Q9DCU6 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl4Q9DCU6 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl4Q9DCU6 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl4Q9DCU6 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl4Q9DCU6 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl4Q9DCU6 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl4Q9DCU6 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl4Q9DCU6 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl4Q9DCU6 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl4Q9DCU6 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl4Q9DCU6 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl4Q9DCU6 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Mrpl4Q9DCU6 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mrpl4Q9DCU6 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mrpl4Q9DCU6 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mrpl4Q9DCU6 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Mrpl4Q9DCU6 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mrpl4Q9DCU6 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mrpl4Q9DCU6 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mrpl4Q9DCU6 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mrpl4Q9DCU6 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mrpl4Q9DCU6 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mrpl4Q9DCU6 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mrpl4Q9DCU6 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mrpl4Q9DCU6 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mrpl4Q9DCU6 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mrpl4Q9DCU6 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mrpl4Q9DCU6 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mrpl4Q9DCU6 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mrpl4Q9DCU6 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Mrpl4Q9DCU6 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mrpl4Q9DCU6 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mrpl4Q9DCU6 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mrpl4Q9DCU6 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Mrpl4Q9DCU6 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mrpl4Q9DCU6 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Mrpl4Q9DCU6 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mrpl4Q9DCU6 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Mrpl4Q9DCU6 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mrpl4Q9DCU6 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mrpl4Q9DCU6 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mrpl4Q9DCU6 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mrpl4Q9DCU6 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mrpl4Q9DCU6 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Mrpl4Q9DCU6 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Mrpl4Q9DCU6 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Mrpl4Q9DCU6 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Mrpl4Q9DCU6 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Mrpl4Q9DCU6 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Mrpl4Q9DCU6 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Mrpl4Q9DCU6 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Mrpl4Q9DCU6 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Mrpl4Q9DCU6 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl4Q9DCU6 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl4Q9DCU6 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl4Q9DCU6 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl4Q9DCU6 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl4Q9DCU6 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl4Q9DCU6 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl4Q9DCU6 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl4Q9DCU6 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl4Q9DCU6 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl4Q9DCU6 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms